随着医疗费用的上涨和保障水平的提高，医保基金中长期支出压力加大，居民医疗保险的巨额财政补贴风险正逐步显现。2016年城镇居民基本医疗保险和新农合的个人缴费比例或将上升。专家认为，从筹资机制来看，财政补助已经占到筹资总额的四分之三左右，居民医保存在“泛福利化”倾向，未来应逐步改变目前个人与财政筹资责任失衡的局面，建立财政补贴与个人缴费的合理分担机制。
但目前对此问题，人社部和卫计委暂未予以明确回复。
出于对参保积极性等因素的考虑，多年来居民医保的个人筹资标准一直以很小的幅度上升，居民医保筹资的增长主要通过财政补贴的增加来实现，财政补贴与个人筹资的比重从最初的1∶1变成了目前的约4∶1。
人社部社会保障研究所所长金维刚认为，居民医保目前筹资比例不合理，筹资水平的增长主要依靠财政，财政补助在整个筹资比例方面占的比重过大，个人缴费所占比重很小，会导致未来医保基金的压力越来越大。与此同时，大多数地区居民医保的报销比例可以达到70%甚至超过70%，与职工的报销比例也就相差10个百分点，而职工医保与居民医保在筹资方面相差几倍，这就导致筹资机制与医保待遇之间出现了一些扭曲的现象。
人社部社会保障研究所医保研究室主任王宗凡也认为，财政补贴比重过大，不仅带来财政是否可支撑的问题，也使得居民医保有滑向福利制度的危险。完善居民医保筹资机制的基本原则，是回归社会保险属性。虽然在法律层面上，我国城镇居民医保制度属于社会保险制度，但是在实践中，居民医保却采取了一些超出常规的政策措施，如自愿参保缴费、主要依赖财政补贴吸引参保、定额缴费、不顾筹资能力过快提升待遇等。”
王宗凡认为，在制度建立之初，这些政策措施有效地促进了参保扩面、增强了制度吸引力，不过随着全民医保的实现，特别是在居民医保待遇水平达到相对较高的水平、基金支出压力越来越大的情况下，应该充分认识到现行筹资政策的局限，逐步增加个人缴费的比重，均衡个人和政府的筹资责任和负担。
对于未来的改革方向，王宗凡认为，调整筹资政策应充分考虑目前面临的困难和阻力，需要循序渐进、逐步推进，不可操之过急。随着居民收入的增长，可参照职工医保缴费单位和个人的分担比（约为3∶1），将居民医保缴费财政和个人分担比的调整目标也确定为3∶1。当然，实现这一目标还需要一个过渡期。
中国社科院财经战略研究院副研究员汪德华接受《经济参考报》记者采访时表示，居民医保的财政补贴是必要的，但是需要一定限制。“因为我国参加城镇居民医保和新农合的人数共约有8、9亿，而财政资金有限，如果都靠财政，那么医疗保障的待遇很难提上去，而且长期看对财政的支出压力会非常大。”他认为，财政和个人分担比逐步调整为1：1是比较合适的。
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