医药冷链物流的关键是要实现全程温度控制，确保降低医药品的损耗，最大限度保证品质，以满足消费者需求。从目前需要冷藏的药品来看，中国医药冷链最容易断链的环节就是医药的冷链运输环节。
医药冷链是一个庞大的物流系统，涉及到多个环节，为保证药品从生产企业到接收单位的运转全过程中均保证冷链不断链，需要在冷链储存、搬运、分拣、配送等各个环节确保药品一直处在一定的温度区间内，需要冷链物流的各类技术装备、存储设施、货运装备的支撑。
从工厂到配送中心，从配送中心到省级客户或地区二级配送中心，从省级客户到市级客户再到县级客户，最终到用户，每个环节均需要冷藏，也需要冷链运输，需要冷藏设施与设备，需要冷藏车、疫苗运输工具，到终端客户冷链药品运输量很小，冷藏车运输不经济，需要移动冰箱、冷藏箱、冷藏包、冰排等。
中国冷链物流存在的主要问题就是政府和各级药品批发部门对冷链物流重视程度不够，尤其是对于冷链运输环节，普遍缺乏重视，更缺乏统一的操作规范与冷链运输标准，缺乏专业的第三方物流公司。由于缺乏第三方物流服务，因此，药品冷链运输如果外包，则成本会大幅度上升，同时由于缺乏诚信和全程可视化监控设施，有些物流公司也可能难以保证全程的冷链运输。
很多医药公司为了确保冷链药品不断链，确保药品安全，往往是医药公司自己组织冷链运输，但是自己进行冷链运输有存在着资金投入不足，运输能力不够，运力难以优化，冷链运输货源难以整合等现象，还会出现冷藏车容积利用率低下，返程难以配货等现象，严重浪费资源。
此外，冷链运输中也存在着设备设施缺乏专业性，缺乏专业人才，缺乏统一标准等问题。尤其是冷链运输普遍缺乏全程、透明的运输监控管理体系，缺乏先进的冷链运输全程温度控制技术标准，缺乏先进的、系列的冷链运输设备。
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