营改增即营业税改增值税，2011年，经国务院批准，财政部、国家税务总局联合下发营业税改增值税试点方案。从2012年1月1日起，在上海交通运输业和部分现代服务业开展营业税改征增值税试点。至此，货物劳务税收制度的改革拉开序幕。
物流是我国最早试点营改增的行业之一。2012年1月1日，上海市最先在交通运输业和部分现代服务业正式实施营业税改征增值税试点，并由金山税务局开出第一张物流业增值税发票。当年8月1日起，试点范围又扩大到北京、江苏、浙江、广东等10个省市。从2013年8月1日，营改增推广到全国范围的物流行业。根据营改增方案，按一般纳税人标准，交通运输业采用11%的增值税税率，代替了过去营业税3%的税率;而仓储、配送和货运代理则采用6%的增值税税率，代替过去营业税5%的税率。
就理论上而言，如果希望执行新政策后的税负不会有大幅度上升的话，物流行业（尤其是陆路交通运输）企业可以做出的选择无外乎几种，1、达不到一般纳税标准，选择按小规模纳税人纳税；（月销售额不超过2万元的企业或非企业性单位，暂免征收增值税）；2、选择按一般纳税人纳税，提高进项税额抵扣；3、充分利用税收优惠政策，申请减税或免税，或者政府补助。
第一种方法，由于只能开具3%的增值税专用发票，虽然自身税负没有上升，但客户肯定更希望按11%抵扣进项税，这就会导致客户可能不愿意接受，从而降低业务量，直接影响营业收入，进而影响企业的生存发展。第二种方法，分为内部和外部的要求。对内，必须要求所有应取得的进项抵扣均最大化获取增值税专用发票；对外，向上游承运或分包企业施加压力，必须获取11%抵扣，自身按进销项差额纳税。结合前两种方法的一个极端例子就是处置现有运输工具，转为投资其他企业或变卖，以中介代理形式开展自身业务。
第三种方法的实现路径也不多，目前看来只有新办安置转业军人或失业人员的企业可以享受免征或减征的税收优惠。申请政府补助还需要视企业所在地政府对该行业的扶持，并且还需对相应标准进行核查。
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