随着医药需求量的大幅上升，医药物流配送中心建设成为我国物流行业发展的重点之一，我国医药行业销售额排名前10位的企业都在花大力气建造或改造物流中心，有的已经建成并开始运营。为了能成为优势外资企业的合作伙伴，国内很多医药企业将投资方向转向医药物流配送中心的建设。还有一些医药企业为了能与外资企业相抗衡，增加自身的竞争能力，同样将物流配送中心建设作为博弈的主要筹码之一。
建设医药物流配送中心无疑是直面这一挑战的有效措施之一。物流既是医药企业新的增长点，也是应对医药需求快速增长的有效方法，同时，它为医药企业发展第三方物流奠定了坚实的基础。医药物流配送中心建设，原则上应该与企业的战略目标相一致，这是医药物流配送中心规划设计首先要解决的问题。
我国医药企业大体可以分为三类：制药企业、批发企业、零售企业。在这三类企业中，医药批发企业对于物流配送中心的需求最为迫切。医药物流配送中心建设规模应与企业销售量(物流量：相一致。目前国内医药流通年营业额在百亿元以上的企业可以考虑建立一级大型现代化物流配送中心，成为全国性或区域性物流配送运营商；对于50～100亿元的流通企业，由于规模的限制，成为地区性物流运营商是较好的选择。
当前我国医药物流网络体系正在形成中，7个区域可发展一级大型医药物流中心，即珠三角物流区、长三角物流区、环渤海物流区、郑州物流区、武汉物流区、西安一兰州物流区、重庆一成都物流区。一般而言，物流配送中心的规划设计包括以下12个过程：项目意向、项目论证、筹资、立项、土地确认、方案设计、建筑方案设计与报批、方案审核、建筑招标、其他招标、竣工验收、运营。这里就其中的关键问题进行讨论。
医药物流配送中心业务包括药品采购、存储、销售和配送四大类。存储：包括入库、分拣出库、分拣补货、盘点、退货等工作。药品销售：包括订单处理、开票、收款、客户管理、售后服务等工作。配送：包括装车、配送路线规划、配送信息反馈、车辆维护与保养、配送费用统计等工作。流程分析决定了医药物流配送中心的总体结构布局，应根据所开展的业务设计其流程，在此基础上进行优化。
功能集成指信息系统提供的功能应满足物流配送中心的业务，并符合医药行业特点。就物流而言，托盘的标准化是一个关键；就医药而言，药品的编码问题还没有解决，此外还有条码、包装尺寸等问题。这些基础工作做不好，信息化就缺乏根基，还会产生许多派生问题并导致混乱。这些工作仅仅依靠个别企业是无法解决的，需要行业的统一规划。
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