上海浦东机场货运公司依托全国民航140个机场和3236条国内、1578条国际、212条地区航线的独特优势，上海浦东机场货运公司建立了国际货件业务通道在北京、上海、广州、香港、厦门、深圳、大连、青岛等。设立分支机构在香港，物流海关监管仓库在广州、厦门、沈阳等地设立，开通了每天的国际货件直通车广州到香港、深圳到香港。同时，构建了仓储、分拨设施在全国各地的分支机，满足不同需求快递、物流客户的。
上海浦东机场货运公司可为客户货件提供南航物流全过程的安全、便捷、准时、诚信、满意的优质服务。上海浦东机场货运公司坚持为客户提供全方位和个性化服务为出发点，即刻上门为客户提供安全、便捷、准时、诚信满意的优质服务。不断对地面运输和配送功能加强、完善，扩展陆路运输能力。公司拥有各种地面运输及运输车辆海关监管。提供空运、地面运输服务根据客户不同需求。现已形成珠江三角洲、长江三角洲以及华北地区的地面陆路运输网络中心。各省内及相邻省、市间地面陆路运输网络也基本形成。
货运站的散货处理系统由6个自动堆垛机组成，分布在两大工作区域内。该设备配置了各种现代化的控制和操作装置，能实现散货箱存取的完全自动化。6个自动堆垛机系统、123台外围设备、散货架高为10层，共有12排、每个货位限重2吨、一期货站有2400个散货货位，该系统用于集装货物的存取和转运。这些功能由两台升降转运车来实现。集装货架为2排，5层高，38列长、共有762个集装货位、由2台20英尺升降转运车操作、转运车最大载重为13.6吨、一期货站有共有762个集装货位；三期货站有930个集装货位。
治安和安全始终是货运站一切经营活动中重要的组成部分。经与机场当局、海关和其他政府机构的通力合作，公司充分意识到公司对航空货运业以及对公众所承担的责任。新投资的安检机、先进的闭路电视监控系统和拥有受过良好职业培训员工的专业安保公司控制货运站全部区域，使得货运站的货物操作更安全并获得一切必要的保护。
